Modeling HIV-1 viral capsid nucleation by dynamical systems
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Modeling HIV-1 viral capsid nucleation by dynamical systems.
There are two stages generally recognized in the viral capsid assembly: nucleation and elongation. This paper focuses on the nucleation stage and develops mathematical models for HIV-1 viral capsid nucleation based on six-species dynamical systems. The Particle Swarm Optimization (PSO) algorithm is used for parameter fitting to estimate the association and dissociation rates from biological exp...
متن کاملModeling Viral Capsid Assembly.
I present a review of the theoretical and computational methodologies that have been used to model the assembly of viral capsids. I discuss the capabilities and limitations of approaches ranging from equilibrium continuum theories to molecular dynamics simulations, and I give an overview of some of the important conclusions about virus assembly that have resulted from these modeling efforts. To...
متن کاملobservational dynamical systems
چکیده در این پایاننامه ابتدا فضاهای متریک فازی را به صورت مشاهدهگرایانه بررسی میکنیم. فضاهای متریک فازی و توپولوژی تولید شده توسط این متریک معرفی شدهاند. سپس بر اساس فضاهایی که در فصل اول معرفی شدهاند آشوب توپولوژیکی، مینیمالیتی و مجموعههای متقاطع در شیوههای مختلف بررسی شده- اند. در فصل سوم مفهوم مجموعههای جاذب فازی به عنوان یک مفهوم پایهای در سیستمهای نیم-دینامیکی نسبی، تعریف شده است. ...
15 صفحه اولjordan c-dynamical systems
in the first chapter we study the necessary background of structure of commutators of operators and show what the commutator of two operators on a separable hilbert space looks like. in the second chapter we study basic property of jb and jb-algebras, jc and jc-algebras. the purpose of this chapter is to describe derivations of reversible jc-algebras in term of derivations of b (h) which are we...
15 صفحه اولPhosphorylation of the HIV-1 capsid by MELK triggers uncoating to promote viral cDNA synthesis
Regulation of capsid disassembly is crucial for efficient HIV-1 cDNA synthesis after entry, yet host factors involved in this process remain largely unknown. Here, we employ genetic screening of human T-cells to identify maternal embryonic leucine zipper kinase (MELK) as a host factor required for optimal uncoating of the HIV-1 core to promote viral cDNA synthesis. Depletion of MELK inhibited H...
متن کاملذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: Mathematical Biosciences
سال: 2015
ISSN: 0025-5564
DOI: 10.1016/j.mbs.2015.10.007